Der Vorteil der Protonenstrahltherapie besteht darin, die Tiefe, in der die Energie in das Gewebe abgegeben wird, sorgfältig auszuwählen, indem die Energie des Strahls angepasst wird. Im Gegensatz dazu geben Photonen oder Elektronen ihre Energie in die äußersten Schichten ab.