Наука вступает в свою Эру Агентности Представляем карту Экосистемы Научного ИИ! 🗺️ Мы составили карту инструментов, моделей и агентных структур, которые питают новый субстрат для биологии Создано, чтобы помочь основателям, исследователям и строителям ориентироваться в взрыве научного ИИ Давайте разберем это🧵

Научные ИИ-агенты больше не являются научной фантастикой 👾 Они могут: → Собирать передовые исследования → Формулировать научные гипотезы → Разрабатывать и проводить эксперименты Но каждая лаборатория строит в изоляции. Вот почему мы видим явную необходимость дополнить то, что создает мир веб2 Агентной Науки.

С этой целью наступает эпоха «коллективного научного интеллекта». От извлечения данных из литературы до автоматизации лабораторий, мы определили 5 ключевых слоев, которые поддерживают научный ИИ и развивают пространство биологического дизайна👇

1. Знания и источники данных Все начинается с данных. Научные агенты используют: • PubMed, Dataverse (статьи и академические данные) • PDB, UniProt (белки) • ChEMBL, PubChem (химия) • Reactome, Gene Ontology (путевые карты) • AACT (клинические испытания) • @biorxivpreprint (предварительные публикации)

2. Агентные Оркестровочные Слои Эти инструменты оживляют рассуждения. Примеры: • @ElizaEcoFund - готовая к использованию агентная структура • ChemCrow - помощник по химии • BioMCP / PubMedMCP - серверы литературы • "Coscientist" - автономный лабораторный агент • @PrimeIntellect - модульная агентная инфраструктура

3. Фондовые и доменные модели Рабочие лошадки с высокой производительностью. Примеры: • AlphaFold 2 - предсказание структуры • Evo 2 - геномное моделирование (Институт Арк) • Geneformer - экспрессия генов • ChemGPT - химическое рассуждение • ESM-3, PaLM-2, Claude 3 - языковые каркасы

4. Эксперименты и выполнение симуляций Искусственный интеллект проводит эксперименты. Системы включают: • Opentrons - API-управляемые лабораторные роботы • INDRA - механистическое моделирование • PyMOL / AlphaFold вывод • Облачная симуляция: OpenMM, Foldit • SMART-on-FHIR: ранняя интеграция ЭМК

5. Платформы и помощники для ученых Где ИИ встречается с исследователями. • @GoogleAI Co-Scientist - мозговой штурм гипотез • @FutureHouseSF - вопросы и ответы, систематические обзоры, планирование в химии • Consensus & Elicit - структурированные обзоры статей • Biomni, Iris, Scite - специализированные агенты для статей • @vita_dao AUBRAI, ChatPaper - сопилоты для исследований с ИИ

Вместе эти инструменты образуют новый стек исследований: → Модели интерпретируют биологию → Агенты организуют рассуждения → Платформы предоставляют помощь → Робототехника и симуляция замыкают цикл

Карта научной экосистемы ИИ — это не просто список инструментов. Это план для био/акк 🧪 От поиска → к синтезу От анализа → к действию От статических знаний → к системам, которые учатся