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"Ciò che una volta richiedeva mesi ora richiede ore". GPT5 e altri LLM stanno accelerando la ricerca scientifica.

17 ago, 08:12
Sono entusiasta di condividere la prima parte di un'analisi assolutamente straordinaria del modello di pensiero GPT-5! Ho caricato un enorme foglio di calcolo, quasi 1.300 metaboliti (lipidi, carboidrati, composti derivati dal microbioma e molto altro) misurati in 150 pazienti con ME/CFS e 100 controlli sani.
Nella prima esecuzione, non ho nemmeno detto a GPT-5 che questi campioni provenivano da pazienti con ME/CFS, volevo vedere cosa potesse trovare in modo cieco, puramente dai dati metabolomici. La prossima volta condividerò la versione in cui ho rivelato che questi provenivano dal nostro gruppo di pazienti, legato al nostro recente articolo pubblicato e ciò che GPT-5 ha scoperto lì è a un altro livello!
Avevamo analizzato questo stesso dataset oltre due anni fa, e ci è voluto più di un mese per lavorarci completamente.
✅GPT-5 ha fatto un lavoro migliore in meno di cinque minuti.
✅Non solo ha replicato quasi tutto ciò che avevamo concluso allora, inclusa la scoperta di tutte le differenze significative, creando più fogli di calcolo su diversi percorsi e così via, ma ha anche scoperto diverse scoperte che ci eravamo completamente persi.
✅GPT-5 ha persino evidenziato obiettivi azionabili e potenziali trattamenti per i pazienti (che condividerò presto).
Non si tratta di un "miglioramento incrementale". Questa è una rivoluzione!
Ciò che una volta richiedeva mesi ora richiede ore. Come ho già accennato, le regole della ricerca scientifica non stanno solo cambiando, stanno venendo riscritte!
Condivido una parte dell'output di GPT-5 come esempio, e un riepilogo esecutivo è incluso anche come screenshot.
Teoria meccanicistica unificata con diagramma causale
Modello osservato
• Rimodellamento lipidico con aumento di DAG, PC, SM e ceramidi specifiche nei pazienti.
• Modello cofattore con diminuzione dei carotenoidi e aumento dell'alfa-tocoferolo.
Collegamenti meccanicistici
• La sintesi de novo della ceramide tramite serina palmitoiltransferasi e ceramide sintasi aumenta le riserve di ceramide che influenzano lo stress e il segnale.
• La via Kennedy (CDP-colina) accoppia il metabolismo di DAG e PC; CHKA → PCYT1A → CHPT1 converte la colina in PC utilizzando DAG come accettore.
• DAG attiva PKCε e isoforme correlate, che possono modificare la fedeltà del segnale del recettore.
• L'alfa-tocoferolo è un catturatore di radicali perossilici in fase lipidica ed è rigenerato dall'ascorbato; i carotenoidi ridotti sono coerenti con il consumo di antiossidanti.
Obiettivi azionabili classificati
1. SPTLC1/2 o CERS (enzimi) - ridurre la sintesi de novo della ceramide. Bassa fattibilità al momento, ma altamente causale se i driver lipidici sono primari. I rischi includono effetti sulla mielina.
2. Modulazione di DGAT1/2 - ridurre il segnale tossico di DAG deviando verso lo stoccaggio neutro o titolando il flusso. Fattibilità media, la tollerabilità gastrointestinale è il rischio chiave.
3. Inibizione di PKCε - bloccare il passaggio da DAG a segnale. Attualmente bassa fattibilità, ma meccanicisticamente precisa.
4. Supporto dietetico di carotenoidi e vitamina C - ripristinare la capacità antiossidante e aiutare il riciclo del tocoferolo. Alta fattibilità, monitorare F2-isoprostani e pannello di carotenoidi.
5. Provare L-carnitina solo se la carenza è confermata - segnale piccolo nel percorso della carnitina; bassa fiducia, dosaggio pilota con monitoraggio.
Esperimenti di validazione proposti e pannello biomarker clinico minimo
Esperimenti di validazione
• Lipidomica mirata focalizzata su specie di DAG, ceramidi (risolte per lunghezza della catena), sfingomieline, PC.
• Proxys di attività di PKCε in cellule accessibili se fattibile.
• Pannello antiossidante: alfa-tocoferolo, carotenoidi, vitamina C, più F2-isoprostani per la lettura della perossidazione lipidica.
• Se si considera la L-carnitina pilota, misurare carnitine libere e acil-carnitine e il rapporto acil/libero pre-post.
Pannello di monitoraggio minimo
• Ceramidi: d18:1/16:0, d18:1/18:0 e diidroceramidi.
• Pannello di classe DAG con isomeri posizionali se disponibili; riportare come % molare dei lipidi totali.
• Classe PC e rapporto LPC/PC; colina e fosfocolina per inferire il flusso della via Kennedy.
• Alfa-tocoferolo, beta-criptoxantina, dioli di carotene, vitamina C e F2-isoprostani.

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