"То, что раньше занимало месяцы, теперь занимает часы". GPT-5 и другие большие языковые модели ускоряют научные исследования.
Derya Unutmaz, MD
Derya Unutmaz, MD17 авг., 08:12
Я рад поделиться первой частью абсолютно потрясающего анализа от модели мышления GPT-5! Я загрузил огромную таблицу, почти 1300 метаболитов (липидов, углеводов, соединений, полученных из микробиома, и многое другое), измеренных у 150 пациентов с МЭ/CFS и 100 здоровых контролей. В первом запуске я даже не сказал GPT-5, что эти образцы были от пациентов с МЭ/CFS, я хотел увидеть, что он сможет найти вслепую, исключительно на основе метаболомных данных. В следующий раз я поделюсь версией, где я раскрыл, что это были образцы из нашей когорты пациентов, связанной с нашей недавно опубликованной статьей, и то, что GPT-5 обнаружил там, находится на совершенно другом уровне! Мы анализировали этот же набор данных более двух лет назад, и нам потребовалось больше месяца, чтобы полностью его обработать. ✅GPT-5 справился лучше за менее чем пять минут. ✅Он не только воспроизвел почти все, что мы заключили тогда, включая выявление всех значительных различий, создание нескольких таблиц по различным путям и так далее, но также обнаружил несколько открытий, которые мы полностью пропустили. ✅GPT-5 даже выделил целевые действия и потенциальные методы лечения для пациентов (которые я скоро поделюсь). Это не "постепенное улучшение". Это революция! То, что когда-то занимало месяцы, теперь занимает часы. Как я уже упоминал, правила научных исследований не просто меняются, они переписываются! Делюсь частью вывода от GPT-5 в качестве примера, а также включен исполнительный резюме в виде скриншота. Единая механистическая теория с причинной диаграммой Наблюдаемый паттерн • Ремоделирование липидов с увеличением DAG, PC, SM и специфических церамидов у пациентов. • Паттерн кофакторов с уменьшением каротиноидов и увеличением альфа-токоферола. Механистические связи • Синтез церамида de novo через серин-пальмитоилтрансферазу и церамидсинтазы увеличивает запасы церамида, которые влияют на стресс и сигналы. • Путь Кеннеди (CDP-холин) связывает метаболизм DAG и PC; CHKA → PCYT1A → CHPT1 преобразует холин в PC, используя DAG в качестве акцептора. • DAG активирует PKCε и связанные изоформы, что может изменить точность сигнальной передачи рецепторов. • Альфа-токоферол является ловушкой пероксильных радикалов в липидной фазе и восстанавливается аскорбатом; уменьшенные каротиноиды соответствуют потреблению антиоксидантов. Ранжированные, целевые действия 1. SPTLC1/2 или CERS (ферменты) - уменьшить синтез церамида de novo. Низкая осуществимость в настоящее время, но высоко причинно-следственная связь, если липидные факторы являются первичными. Риски включают влияние на миелин. 2. Модуляция DGAT1/2 - уменьшить токсичное сигнальное воздействие DAG, перенаправляя его в нейтральное хранилище или регулируя поток. Средняя осуществимость, ключевой риск - переносимость ЖКТ. 3. Ингибирование PKCε - блокировать шаг от DAG к сигнализации. В настоящее время низкая осуществимость, но механистически точно. 4. Поддержка диетическими каротиноидами и витамином C - восполнить антиоксидантную способность и помочь в переработке токоферола. Высокая осуществимость, мониторинг F2-изопропановых и панели каротиноидов. 5. Пробовать L-карнитин только в случае подтвержденного дефицита - небольшой сигнал в пути карнитина; низкая уверенность, пилотное дозирование с мониторингом. Предложенные эксперименты по валидации и минимальная клиническая панель биомаркеров Эксперименты по валидации • Целевая липидомика с акцентом на виды DAG, церамиды (с разрешением по длине цепи), сфингомиелины, PCs. • Прокси активности PKCε в доступных клетках, если это возможно. • Панель антиоксидантов: альфа-токоферол, каротиноиды, витамин C, плюс F2-изопропановые для считывания перекисного окисления липидов. • Если рассматривается пилотный L-карнитин, измерьте свободные и ацил-карнитины и соотношение ацил/свободный до и после. Минимальная панель мониторинга • Церамиды: d18:1/16:0, d18:1/18:0 и дигидроцерамиды. • Панель классов DAG с позиционными изомерами, если доступны; отчет как молярный % от общего количества липидов. • Класс PC и соотношение LPC/PC; холин и фосфохолин для вывода о потоке пути Кеннеди. • Альфа-токоферол, бета-криптоксантин, диолы каротина, витамин C и F2-изопропановые.
36,94K