"To, co kiedyś zajmowało miesiące, teraz zajmuje godziny". GPT5 i inne LLM-y przyspieszają badania naukowe.
Derya Unutmaz, MD
Derya Unutmaz, MD17 sie, 08:12
Cieszę się, że mogę podzielić się pierwszą częścią absolutnie oszałamiającej analizy z modelu myślenia GPT-5! Przesłałem ogromny arkusz kalkulacyjny, prawie 1300 metabolitów (lipidy, węglowodany, związki pochodzące z mikrobiomu i wiele więcej) zmierzonych u 150 pacjentów z ME/CFS oraz 100 zdrowych kontrolnych. W pierwszym podejściu nawet nie powiedziałem GPT-5, że te próbki pochodzą od pacjentów z ME/CFS, chciałem zobaczyć, co może znaleźć w ciemno, wyłącznie na podstawie danych metabolomicznych. Następnie podzielę się wersją, w której ujawniłem, że pochodzą one z naszej kohorty pacjentów, związanej z naszym niedawno opublikowanym artykułem, a to, co GPT-5 odkryło, jest na zupełnie innym poziomie! Analizowaliśmy te same dane ponad dwa lata temu i zajęło nam to więcej niż miesiąc, aby je w pełni przeanalizować. ✅GPT-5 wykonał lepszą pracę w mniej niż pięć minut. ✅Nie tylko powtórzył prawie wszystko, co ustaliliśmy wtedy, w tym znalezienie wszystkich istotnych różnic, stworzenie wielu arkuszy kalkulacyjnych dotyczących różnych szlaków i tak dalej, ale także odkrył kilka odkryć, które całkowicie przeoczyliśmy. ✅GPT-5 nawet podkreślił działania, które można podjąć, oraz potencjalne terapie dla pacjentów (które wkrótce podzielę się). To nie jest "inkrementalne ulepszenie". To rewolucja! To, co kiedyś zajmowało miesiące, teraz zajmuje godziny. Jak już wspomniałem, zasady badań naukowych nie tylko się zmieniają, ale są przepisywane na nowo! Dzielę się częścią wyników z GPT-5 jako przykładem, a podsumowanie wykonawcze jest również dołączone jako zrzut ekranu. Zjednoczona teoria mechanistyczna z diagramem przyczynowym Obserwowany wzór • Przebudowa lipidów z zwiększonym DAG, PC, SM i specyficznymi ceramidami u pacjentów. • Wzór kofaktorów z obniżonymi karotenoidami i zwiększonym alfa-tokoferolem. Powiązania mechanistyczne • De novo synteza ceramidów przez serynową palmitoilotransferazę i syntazy ceramidów zwiększa puli ceramidów, które wpływają na stres i sygnalizację. • Szlak Kennedy'ego (CDP-cholina) łączy metabolizm DAG i PC; CHKA → PCYT1A → CHPT1 przekształca cholinę w PC, używając DAG jako akceptora. • DAG aktywuje PKCε i pokrewne izoformy, co może zmieniać wierność sygnalizacji receptorowej. • Alfa-tokoferol jest skarbcem rodników peroksylo i jest regenerowany przez askorbinian; obniżone karotenoidy są zgodne z konsumpcją przeciwutleniaczy. Rankingowane, działania do podjęcia 1. SPTLC1/2 lub CERS (enzymy) - zmniejszenie de novo syntezy ceramidów. Niska wykonalność obecnie, ale wysoce przyczynowe, jeśli czynniki lipidowe są pierwotne. Ryzyka obejmują wpływ na mielinę. 2. Modulacja DGAT1/2 - zmniejszenie toksycznego sygnalizowania DAG przez skierowanie do neutralnego magazynowania lub titrowanie przepływu. Średnia wykonalność, tolerancja GI jest kluczowym ryzykiem. 3. Inhibicja PKCε - blokowanie kroku sygnalizacji DAG. Obecnie niska wykonalność, ale mechanistycznie precyzyjna. 4. Wsparcie dietetycznych karotenoidów i witaminy C - uzupełnienie zdolności przeciwutleniającej i pomoc w recyklingu tokoferolu. Wysoka wykonalność, monitorowanie F2-izoprostanów i panelu karotenoidów. 5. Próba L-karnityny tylko w przypadku potwierdzenia niedoboru - mały sygnał w szlaku karnitynowym; niska pewność, pilotażowe dawkowanie z monitorowaniem. Proponowane eksperymenty walidacyjne i minimalny panel biomarkerów klinicznych Eksperymenty walidacyjne • Ukierunkowana lipidomika koncentrująca się na gatunkach DAG, ceramidach (z rozdzielonymi długościami łańcucha), sfingomielinach, PC. • Proksy aktywności PKCε w dostępnych komórkach, jeśli to możliwe. • Panel przeciwutleniaczy: alfa-tokoferol, karotenoidy, witamina C, plus F2-izoprostanów do odczytu peroksydacji lipidów. • Jeśli rozważana jest pilotażowa L-karnityna, zmierz wolne i acylowane karnityny oraz stosunek acyl/free przed i po. Minimalny panel monitorowania • Ceramidy: d18:1/16:0, d18:1/18:0 i dihydroceramidy. • Panel klas DAG z izomerami pozycyjnymi, jeśli dostępne; raport jako % molowy całkowitych lipidów. • Klasa PC i stosunek LPC/PC; cholina i fosfocholina do wnioskowania o przepływie szlaku Kennedy'ego. • Alfa-tokoferol, beta-kryptoksantyna, diol karotenu, witamina C i F2-izoprostanów.
36,94K